拉入食骨之井中，跌入犬夜叉被封印后50年的战国时代。
日暮戈薇与被封印在御神木上的犬夜叉邂逅，并在迫不得已的情况下解开了少年犬夜叉的封印。
在随后与妖怪的战斗中戈薇的箭，射中了四魂之玉，最后使之散落成碎片。
一心想变成大妖怪的犬夜叉，无奈之下跟能看见四魂之玉的戈薇，不得不陪伴着戈薇去寻找四处飘落的碎片。
然后，这就开始了一段寻找四魂碎片的旅程。
在寻找的途中，又碰到了七宝、弥勒、珊瑚，并与他们成为了伙伴。
这些伙伴们，都有着悲惨的遭遇。
小狐狸七宝的爸爸被雷兽兄弟所杀害，所以来抢戈薇手中的四魂之玉。
不过，后来犬夜叉杀掉了雷兽兄弟，替七宝报了仇。
无家可归的七宝便跟随犬夜叉他们，一起开始了寻找四魂之玉碎片的旅途。
弥勒的家族，从祖父开始被奈落下了风穴的诅咒，右手掌上的洞可以无限吸进任何东西，最终连自己都会被吸入消失。
他的父亲和祖父都是因为这样，从而失去了生命。
弥勒便想抢到四魂之玉杀掉奈落解除诅咒，同时为家人报仇。
此间遇到了犬夜