第二，张居正专权。张居正自从正式担任内阁首辅后，所有的权力一把抓。不但在内阁说一不二，而且开始插手其他衙门机构的事务。张居正的强势虽然让一些人畏惧，但是更加让大家开始厌恶和反感张居正。张居正已经成为了大家的目标，所有的人开始猜测张居正的结果。张居正要求各级衙门特别是在京的各个衙门必须定期想自己做汇报，任何一件大事都必须让自己第一时间知道并由自己亲自决定。虽然内阁名义上是最高衙门，就算是六部衙门也需要在内阁的指挥下办事，但是六部衙门历来是只听从自己衙门一把手尚书大人的。可是张居正当上内阁首辅后，直接越过六部尚书管理六部衙门事务，几乎架空了六部尚书。这种做法不但引起了六部尚书等人不满，也让大家觉得张居正太过了。可是张居正一点也不觉得自己做错了，他觉得自己帮六部尚书做了不少事情，六部尚书还要感谢自己。多次在给秦泰的书信里面，张居正提到自己事情多看得六部尚书太清闲，其实当时秦泰就已经察觉到不对劲了。张居正这样霸着权力不放手，将来会给他自己带来许多的麻烦。
官场上的事情不能只看表面，有一句老话叫“不干不错，越干越错。”当年三国时期的诸葛孔明就是这样一个人，他担任蜀国丞相的时候