年9月，在抚顺近郊制造平顶山惨案，屠杀村民3000余名，全村仅存活1人。
在日本侵华的历史上，规模最大的一次屠杀发生在南京。侵华日军松井石根所部于1937年12月13日攻陷南京后疯狂杀戮，血染古城，使30万以上的南京市民和放下武器的军人惨遭屠杀，1/3的街道和建筑物被焚毁；同时，还制造了2万起左右的强奸事件，进行了大规模的抢劫。日军的残暴与野蛮实在是骇人听闻、罪大恶极。
日本侵略军在对抗日根据地血腥“扫荡”中，推行野蛮的“三光”政策，犯下了累累血债。据统计，从1937年—1945年，仅晋绥、晋察冀、冀热辽、晋冀鲁豫、山东、苏皖、中原7个抗日根据地，中国军民就被日军杀害318万人。
在侵华战争中，日本公然违背国际法，在中国研制和使用细菌武器，进行细菌战，大量残杀中国人民。臭名昭著的“第731部队”、“第100部队”等细菌战部队，总人数达2万余人。他们还对实验对象进行活人解剖。每年用于试验的人达400—600人。据不完全统计，从1939年—1945年8月，“731部队”至少残害了3000多人。
从1940年下半年开始，侵华日军开始大量使用细菌