昊天宫规模庞大，掌门之下有数十个宗门分管门派各种事物。这些宗门中实力也是各有不同，最强的三个宗门分别是紫霄宗、重华宗、玉清宗，被称为上三宗。上三宗在昊天宫内部也以内门相称，原因就是这三个宗门全部有世家把持，三宗拥有大量外来的资源投入，实力当然冠绝昊天宫。
有内门也就有外门。加入外门的弟子大多是平民出身，也有一些上不了台面的小家族子弟。外门宗门数量众多，昊天宫也鼓励有所成就者开立自己的宗门将所学传授下去。因此只要境界达到大天位且在某一领域有独到之处的昊天宫弟子，就可以申请设立自己的宗门。
外门诸多宗门也是有高下之分，而且他们还没有像世家那样的外来资源，只能依靠门派分拨。因此为门派资源可以得到合理的分配，昊天宫每年外门各宗都要进行考核排名。排名靠前的宗门自然得到门派的支持就多，排名靠后分到的资源就会少很多，这些宗门日子过清苦不说，没有资源就很难把弟子培养成材，没有杰出弟子又拿不到好名次，久而久之就造成昊天宫排名靠前和靠后宗门之间悬殊极大。
对宗门来说，弟子是一种极重要的资源。有大潜力的弟子会被那些强大宗门追逐，那些平平之辈只能加入那些二三流宗门。