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总是上着重复内容的历史课结束之后，下午的课程，就是各自的武艺修练。文武并重，是这个学堂的基本精神，在上午的文课授业结束后，下午的武艺修练中，学生可以自由选修各自喜好的武术，无论是拳脚刀剑、内功轻功，学校里头都有教材可供研读修练。
所谓的教材，都是各门各派的武术秘籍，里头有些甚至被视为高度机密，像梁山泊这等规模的私立小学堂，照理说是根本不可能搜罗到太多数据。然而，梁山泊的特殊人文背景，为学堂提供了一个很好的环境，太平军国之乱所造成的新移民，来自天南地北，所修习的武术包含各家各派，范围极其辽阔，当这些人把自己的武术心得默写整理，提供给学堂当教材，无形中就是最丰富的资产。
目前学堂的藏书中，最齐全的科目不是刀剑拳脚，而是各家各派的内功心法，因为法宝持用者必须不断消耗精气，维持法宝的运作，所以为了减轻身体负担，最好是先提升本身的内功修为，内功越强，才越禁得起法宝对的损耗。
每到下午的武修课，几乎九成的学生都各自觅地修练内功，因为他们几乎都是太平军残兵之子，父执辈所传授下来的，也都是作法宝的技巧，加上梁山泊中大量使用法